На эмблеме изображены космический корабль «Атлантис» и Международная космическая станция в конфигурации, которую она приобретет после успешного выполнения задачи миссии STS-104 - с присоединенной шлюзовой камерой. Расположенный в центре символ Корпуса астронавтов США является данью многим экипажам, летавшим прежде.
В ОПН шаттла видны компоненты полезной нагрузки: сама шлюзовая камера и четыре баллона с газом высокого давления. Фоном всей композиции является фрагмент флага США. По словам представителя экипажа: «Звезды и полосы символизируют надежное сотрудничество наций при осуществлении смелого международного проекта, а также наших детей - наше будущее» (На флаге видны 12 звезд и полос, что соответствует числу детей у астронавтов, а также количеству стран-участниц проекта МКС).
Описание эмблемы - Леон Розенблюм
