Первый набор астронавтов в Японии (NASDA Group 1) проводился в 1984 – 1985 годах. В соответствии с японо-американским соглашением, первый японец должен был совершить полет на американском шаттле уже в 1988 году. Но из-за катастрофы шаттла Challenger полет состоялся только в 1992 году. К этому времени в космос успел слетать непрофессиональный космонавт из другого набора.
В 1990 году исполнялось 40 лет японской телекомпании Tokyo Broadcasting System (TBS). И она решила отметить это событие космическим полетом своего журналиста. В 1989 году был проведен набор TBS, и в декабре 1990 года журналист Тоёхиро Акияма (Toyohiro Akiyama) стал первым японцем, посмотревшим на Землю со стороны.
Второй набор (NASDA Group 2) проводился в 1991 – 1992 году, когда было нужно пополнить отряд японских астронавтов, готовившихся стать специалистами по полезной нагрузке, астронавтом, который будет готовиться по программе специалиста полета. Правда потом и другие астронавты тоже прошли такую подготовку.
Третий набор (NASDA Group 3) проводился в 1995 – 1996 годах. Необходимость пополнения отряда астронавтов была вызвана началом работ по программе создания Международной космической станции, для которой Япония должна была построить один из научных модулей станции.Четвертый набор (NASDA Group 4), проводившийся в 1998 году, служил тем же целям — увеличить отряд астронавтов, которым предстоит работать на Международной космической станции после ее постройки.
Пятого набора (JAXA Group 5) пришлось ждать целых 10 лет. Начавшийся в конце марта 2008 года набор завершился 25 февраля 2009 года, когда были названы имена двух кандидатов в астронавты. В начале сентября из числа финалистов был отобран еще один кандидат. Таким образом, по итогам набора к подготовке в качестве астронавтов приступило три человека.
Шестой набор начался лишь через 13 лет. О проведении в 2021 году очередного набора астронавтов впервые сообщил в своем интервью министр науки Японии Хагиуда Коити (Hagiuda Koichi) 23 октября 2020 года. Официальное объявление о начале набора было сделано 19 ноября 2021 года, а прием заявлений стартовал 20 декабря 2021 года.
В апреле 2023 году появилась информация, что отныне JAXA планирует проводить отбор астронавтов примерно раз в пять, таким образом седьмой набор может стартовать в 2028 году.